单细胞3’转录组测序

 

 

产品简介

 

单细胞转录组测序是一种在单个细胞水平，一次性实现对几百到几万个细胞的mRNA进行高通量测序的技术。单细胞3' 转录组测序主要是通过捕获序列末端的poly(dT)结构，捕获mRNA 3' 末端的序列进行高通量测序，通常捕获到的是成熟RNA或者已经被Polymerase II进行加工的RNA，因此可以更好地反映RNA的稳定性和表达水平。随着单细胞测序技术的不断更新和发展，其在解析细胞异质性，揭示微环境中细胞群体间的关系，追踪疾病发生发展等研究中将发挥越来越重要的作用，后续可为个性化预防、治疗提供技术支持。

 

单细胞测序和传统测序的区别

 

 

服务流程

 

高通量单细胞测序服务流程

 

 

支持平台

 

百奥益康CelCode^®单细胞平台

 

 

 

 

10x Genomics Chromium Controller单细胞平台

 

 

 

 

10x Genomics Chromium X单细胞平台

 

 

结果展示

 

细胞聚类分析

 

细胞分群图（左1）； 亚群Marker基因注释（左2）； 细胞亚群特征基因聚类热图（右1）； 小提琴图（右2）

 

 

功能富集分析

 

GO 富集分析（左1）； KEGG富集分析（左2）； GSEA富集分析（右1）； 蛋白互作网络分析（右2）

 

细胞轨迹分析

 

基因表达拟时间分析（左）； RNA Velocity 分析（右）

 

 

细胞互作分析

 

细胞互作图（左1）； 基因表达相关性关联图（左2）； Cluster 间的互作关系网（右1）； 配体受体互作分析（右2）

 

 

 

产品优势

 

超高通量

 

单次实验可以对上万个细胞进行高通量分离、标记；

 

 

高捕获率

 

每个样本捕获效率高达65%，高效捕获每个细胞中的基因表达信息；

 

 

高性价比

 

与低通量或传统人工操作等方法相比，成本降低数十倍；

 

 

广泛应用

 

对细胞类型无限制，已广泛应用于识别细胞周期、肿瘤细胞异质性、鉴定罕见细胞类型、免疫细胞分析、疾病分型等领域；

 

 

经验丰富

 

百奥益康技术团队现已累积150余种不同组织类型、10,000+个样品的单细胞测序经验。

 

应用方向

 

1.人类细胞图谱构建          2.肿瘤异质性研究          3.干细胞发育以及分化

 

4.免疫反应研究           5.神经系统发育研究          6.器官发育研究

 

 

应用案例

 

 

人类大脑发育早期的综合细胞图谱

 

Comprehensive cell atlas of the first-trimester developing human brain

 

发表杂志：Science（IF：56.9）

 

发表时间：2023年10月

 

应用技术：单细胞转录组测序、空间转录组测序、原位测序

 

 

成年人的大脑由一千多种不同的神经元和神经胶质细胞组成，这种多样性在大脑发育早期就已经出现。为了精准地揭示大脑早期发育机制，本研究机制单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了人类大脑在怀孕后5至14周（pcw）的细胞状态和轨迹。鉴定出12个主要细胞类型，大约600种不同的细胞状态，对5 pcw的样本进行精确的空间解剖域。详细描述了人类前脑和中脑的分化轨迹，并发现大量区域特异性胶质母细胞成熟为不同的前星形胶质细胞和前少突胶质细胞前体细胞。该研究揭示了在人类大脑发育的前三个月细胞类型的建立，为解释许多区域特异性发生模式或严重的脑部疾病以及确定影响特定脑细胞群的人类疾病的治疗靶点提供了丰富的资源。

 

 

研究结果概述

 

 

细胞分群图