在近期摩根大通（JP Morgan）会议上，10x Genomics正式发布了空间转录组升级版新产品——Visium HD。该产品旨在满足客户对更高分辨率Visium产品的需求，通过单细胞尺度分辨率增强了已经验证的全转录组空间分析，实现了连续的组织覆盖，并通过创新探针和搭载Visium Cytassist平台提供了一流的数据。

 

 

工作原理

 

Visium HD空间基因表达玻片包含两个6.5 x 6.5 mm的捕获区域，其中寡核苷酸连续排列在数百万个无间隙的2 x 2 µm条形码标记的正方形中，实现单细胞级空间分辨率，划重点NO GAPs！

 

Visium HD平台捕获数目也从5千个spot大幅提升到1100万个square，在HD平台上读出panel所需的测序量也是Visium平台的两倍。

 

 

工作流程

 

Visium HD同样基于已有 CytAssist 仪器，简便化操作流程，样本不需要经过透化测试实验，就可以轻松获得高质量数据。

 

 

适用范围

 

HD平台提供了全转录组测序，兼容物种还是人和小鼠，兼容组织类型是FFPE组织样本（组织块或是已经已经切好的组织玻片），未来Visium HD 将支持更多其他组织类型。

 

 

清晰直观的数据可视化

 

将数千个基因的表达映射到显微镜成像的H&E或IF图像上，让研究者们更简便直观的观测特异性组织区域和差异基因的表达区域信息。

 

Visium HD支持更精细图谱的绘制，如肠绒毛的细胞组成图谱

 

 

小鼠肠道 Visium HD 数据展示

 

前列腺癌全转录组图谱

 

人乳腺导管原位癌全转录组图谱

 

Visium HD支持微小生物结构(如血管)中细胞类型的空间组织图谱

 

 

Visium HD支持定位组织驻留细胞群，包括免疫细胞或癌细胞，发现它们的相互作用和对疾病或治疗反应的贡献。

 

 

Visium HD已经完成内测的组织类型

 

 

平台间性能比对

 

 

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