全转录组测序

 

背景介绍

 

表观基因组学修饰可以通过调控基因表达，参与细胞和组织分化、发育、衰老、环境适应等一系列过程。大量的研究表明，表观遗传修饰的异常也会引起细胞、组织、器官，乃至整个机体的结构和功能改变，甚至导致疾病的发生，尤其是 DNA 甲基化（DNA methylation）变化会伴随着许多复杂疾病（如肿瘤、精神类疾病、心血管疾病等）的早期发生到后期发展，并可作为临床疾病全过程管理（包括早期诊断、个性化医疗、复发检测、慢性疾病的风险评估等）的生物标志物。因此，对DNA甲基化的深入研究有助于了解疾病发病机制，发现疾病相关的分子标志物，为精准医学发展奠定基础。

 

DNA甲基化与肿瘤风险预测

 

 

 

产品简介

 

全基因组甲基化测序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS）是将重亚硫酸盐处理方法和 Illumina 高通量测序平台相结合，进行全基因组范围内的精确甲基化研究。WGBS 可以达到单碱基分辨率，精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态，从而构建精细的全基因组 DNA 甲基化图谱。

 

 

技术路线图

 

技术原理

 

提取后的DNA经酶切、富集后，利用重亚硫酸盐进行处理，其原理是正常的胞嘧啶（C）经重亚硫酸盐处理后会形成尿嘧啶（U）,在后期PCR时会形成胸腺嘧啶（T）。而经修饰的C（5mC/5hmC）则不会被重亚硫酸盐转化，在测序时保留为C。处理后的DNA后续通过二代测序检测甲基化位点。

 

甲基化位点检测原理

 

结果展示

 

 

 

相关性分析（左）； 甲基化程度热力图（中）； 聚类热图（右）

 

差异位点分布circos（左）； 无监督聚类树状图（中）； 富集分析气泡图（右）

 

产品优势

 

 

精准高效

基于全基因组重亚硫酸盐转化的WGBS法，实现单碱基分辨率的甲基化位点精准、高效定位。

 

金标准

精准获得全基因组甲基化的C位点，是甲基化测序的金标准；

 

快速准确

全面分析不同处理对全基因组甲基化水平的影响，快速准确地找到差异甲基化区域。

 

送样要求

 

 

应用方向

 

 

应用案例

 

异常甲基化是胰岛素瘤中胰岛素基因表达的基础

发表杂志：Nature Communications（IF：14.919）； 发表时间： 2020年 10月； 应用技术：全基因组甲基化测序

 

人类胰岛素瘤是一种罕见良性缓慢增殖，并产生胰岛素的β细胞肿瘤，为研究者理解人类β细胞再生的途径提供了分子“路线图”。此前研究发现，β细胞体积增大和功能紊乱疾病——先天性高胰岛素血症，在11号染色体p15.5-p15.4印记区存在异常的甲基化。本文中，研究者比较了19个人类胰岛素瘤和5组正常β细胞，通过甲基化测序分析，在瘤内发现了一致很高的异常甲基化模式。结果表明，异常的胰岛素（INS）启动子甲基化和转录因子表达的产生INS表达的另一种驱动因素， 用病理的、基于远端增强子的转录调控形式取代了典型的PDX1 驱动的β细胞模式，推测由转录因子NFaT驱动INS失活， 而不是典型的PDX1 增强子复合物。

 

启动子DNA甲基化对基因表达的影响