单细胞5’转录组测序+免疫组库测序

 

 

产品简介

 

单细胞转录组测序是一种在单个细胞水平，一次性实现对几百到几万个细胞的mRNA进行高通量测序的技术。单细胞5' 转录组测序主要是通过捕获序列末端的TSO结构，捕获mRNA 5' 末端的序列进行高通量测序。它通常能捕获到靠近5' 端的免疫组V(D)J基因和一些未经加工的RNA，可用于探索免疫细胞的表达谱和多样性、RNA起始位点和转录调控机制。

 

单细胞5’转录组+免疫组库联合测序，可以高通量的检测单个细胞中5’mRNA表达以及全长TCR/BCR多样性信息。既可以通过单细胞转录组信息发现一块组织内细胞的异质性，还可以通过检测TCR和BCR的克隆型来了解不同状态下生物体的免疫系统组成，辅助自身免疫病、炎症、感染性疾病、肿瘤免疫等研究，加速了对机体免疫系统的理解。

 

 

单细胞5’转录组测序产品凝胶珠构成

 

 

单细胞免疫组库测序技术流程

 

 

服务流程

 

 

高通量单细胞测序服务流程

 

 

结果展示

 

 

单细胞转录组数据分析

 

细胞分群图（左1）； 细胞亚群特定基因表达热图（左2）； 拟时间序列分析（右1）； 蛋白互作网络分析（右2）

 

 

单细胞免疫组库数据分析

 

V(D)J基因组合（左1）； V(D)J基因使用频率统计（左2）； B细胞克隆型注释（右1）； 多样本比较分析（右2）

 

 

单细胞转录组与单细胞免疫组库联合分析

 

基于克隆型信息重建细胞亚群（左）； TCR在表达谱的映射（右）

 

 

产品优势

 

超高通量

 

单次实验可以对上万个细胞进行高通量分离、标记；

 

 

高捕获率

 

每个样本捕获效率高达65%，高效捕获每个细胞中的基因表达信息；

 

 

高性价比

 

与低通量或传统人工操作等方法相比，成本降低数十倍；

 

 

广泛应用

 

对细胞类型无限制，已广泛应用于识别细胞周期、肿瘤细胞异质性、鉴定罕见细胞类型、免疫细胞分析、疾病分型等领域；

 

 

经验丰富

 

百奥益康技术团队现已累积150余种不同组织类型、10,000+个样品的单细胞测序经验。

 

 

应用方向

 

肿瘤免疫          感染性疾病          自身免疫病         免疫系统发育与分化 

 

移植和免疫重塑          炎症反应         疫苗和抗体          生物标记物

 

 

支持平台

 

10x Genomics Chromium Controller单细胞平台

 

 

 

10x Genomics Chromium X单细胞平台

 

 

应用案例

 

儿童白血病中与持久性CD19 CAR-T细胞相关的转录特征

 

Transcriptional signatures associated with persisting CD19 CAR-T cells in children with leukemia.

 

发表杂志：Nature Medicine（IF：82.90）

 

发表时间：2023年7月

 

应用技术：单细胞转录组测序、免疫组库测序

 

CAR-T细胞疗法已被证明在治疗血液系统恶性肿瘤中具有显著疗效。然而，不同患者对CAR-T细胞治疗的反应存在差异。此文章的研究团队使用scRNA-seq，scTCR-seq等技术，对10例复发难治性儿童急性B淋巴细胞白血病（relapsed and refractory childhood pre-B cell acute lymphoblastic leukemia，R/R B-ALL）患者接受CD19 CAR-T细胞治疗后5年内的血液和骨髓样本进行了深入的分析。发现长寿命CAR-T细胞具有CD4/CD8双阴性表型和疲劳样记忆状态，并具有独特的转录特征。这种持久性特征在所有长期治疗反应良好的儿童中占主导地位，并在两名慢性淋巴细胞白血病成年患者中检测到。这些发现提出了一种可能性，即临床有效的、持久的CD19 CAR-T细胞存在通用的转录特征。