细胞治疗:CAR-T预后评估,个体化CAR-T精准治疗指导,IPSC细胞亚群类型鉴定

 

通过单细胞转录组检测,找到影响治疗效果的关键基因以及所在的细胞亚群,进而对患者采取更加精准的治疗方案。

通过检测单个细胞分泌的功能性细胞因子,同时从表型和功能上对CAR-T细胞产品进行全面的效能或质量评估,建立CAR-T细胞的效能与疗效的关系。

通过单细胞技术一次性高通量完成IPSC诱导多能干细胞衍生的细胞簇进行细胞群和亚群的鉴定及不同细胞中基因表达谱的检测,为药物干预及治疗提供精准分析数据。

单细胞转录组分析不同时期病人CAR-T细胞的基因表达特征。

 

 

产品优势

 

超高通量

标准模式下,每个样本可检测500-10,000个细胞,高通量模式下,每个样本可检测1,000-20,000个细胞;

 

高捕获率

每个样本捕获效率高达65%,高效捕获每个细胞中的基因表达信息;

 

高性价比

与低通量或传统人工操作等方法相比,成本降低数十倍;

 

广泛应用

对细胞类型无限制,已广泛应用于识别细胞周期、肿瘤细胞异质性、鉴定罕见细胞类型、免疫细胞分析、疾病分型等领域;

 

经验丰富

百奥益康技术团队现已累积100余种不同组织类型、数千余个样品的10x Genomics单细胞测序经验。

 

 

送样要求

 

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应用案例

 

单细胞转录组分析不同时期病人CAR-T细胞的基因表达特征

 

Clonal kinetics and single-cell transcriptional profiling of CAR-T cells in patients undergoing CD19 CAR-T immunotherapy

 

发表杂志Nature communications(IF: 17.694); 发表时间: 2020年 1月; 应用技术: 10x Genomics单细胞转录组测序

 

通过单细胞测序,探究了CAR-T细胞在输注后不同时期( IP、早期、晚期、超晚期83-112天)的基因表达特征,对另外的2名慢性淋巴细胞白血病( CLL)和2个非霍奇金淋巴瘤( NHL)患者进行单细胞转录组测序,以EGFRt基因表达筛选细胞。数据结果发现, IPs 中的CAR-T细胞可根据其基因表达特征分成4簇: T细胞活化相关、细胞毒性相关、线粒体相关及细胞周期/增殖相关。为了解不同基因表达特征是否是影响输注后克隆扩增的因素,本研究结合单细胞转录组测序及免疫组库V(D)J测序的结果分析发现,输注早期丰度增高的克隆型相比于丰度降低的克隆型,细胞毒性和细胞增殖相关基因的表达量上升,印证了在IPs中CD27+CD8+ T比例与CCL病人临床疗效相关。

 

CD8+ CAR-T细胞的克隆和基因表达特征

 

 

百奥益康单细胞测序

为生物医药研发企业客户提供单细胞水平多组学精准解决方案

 

服务类型

 

 

服务流程

 

 

技术平台

 

10x Genomics单细胞转录组平台

 

 

Mission Bio 单细胞基因组平台

 

 

IsoPlexis 单细胞蛋白质组平台

 

 

NGS平台:全转录组WTS测序、全基因组WGS测序、全基因组WES测序等平台。