CelCode® 高通量单细胞转录组试剂盒

 

 

产品简介

 

 

Celcode®高通量单细胞转录组试剂盒为百奥益康完全自主研发的,与Celcode® Driver单细胞平台配套使用可在极短的时间内完成上万个单细胞的高通量分离、捕获和标记,及后续的单细胞文库构建。

 

 

Celcode®高通量单细胞转录组试剂盒包括:CelCode®高通量单细胞3'转录组芯片BA1套装、CelCode®高通量单细胞3'转录组胶珠试剂盒、反转录试剂盒、建库引物试剂盒、建库试剂盒。运用该系列试剂盒对单细胞进行建库构建和测序后,可一次性获得大量细胞的基因表达信息,大大提高高通量单细胞测序实验的效率和质量,可广泛应用于肿瘤研究、个体发育、复杂疾病机制研究、药物研发等领域。

 

 

 

特点优势

 

灵活多样

 

支持1-4个样本灵活上机

 

适用于所有含Ploy A尾的物种

 

 

性能优异

 

高通量:每个反应捕获细胞数500-10,000

 

高捕获率:细胞捕获率可达65%

 

低多胞率:多细胞率每1,000细胞<0.7%

 

 

高效率

 

6分钟极速完成油包水实验

 

细胞到测序文库仅需8小时

 

 

 

原理流程

 

 

Celcode®系统基于微流控技术分选单个细胞,将带有Barcode和引物的凝胶珠以及单个细胞包裹在油滴中,逆转录后产生带Barcode的cDNA,油滴破解后,对cDNA进行建库和高通量测序,即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据,从而实现细胞亚群分类与细胞群体间标记物筛选。

 

 

百奥益康CelCode® 单细胞测序原理

 

CelCode®单细胞胶珠为百奥益康完全自主设计研发,胶珠上种有特定的引物,由R1、CellBarcode、UMI、Poly d(T)四部分组成。

 

R1: 测序引物,用于后续高通量测序;

 

CellBarcode: 细胞标签,每个胶珠仅对应一个特定的Cell Barcode;

 

UMI:mRNA分子标签,标记mRNA片段,从而消除PCR偏差:

 

Poly d(T)与mRNA 3'端poly(A)结合,用于后续的反转录过程。

 

 

 

 

测试数据

 

 

基因检出率高:

 

利用百奥益康CelCode®高通量单细胞测序系统和某进口单细胞测序系统分别检测一分为二的同一份小鼠脑单细胞悬液样本,进行两次独立单细胞测序测试,结果显示两次测试数据细胞聚类分群一致,基因中位数分别为2,593和2,399,说明该系统基因检出效率高,性能优秀。

 

 

同一份小鼠脑样本两平台独立实验结果展示(左侧为CelCode®单细胞平台结果,右侧为某进口平台结果)

 

 

数据产出稳定性强:

 

利用百奥益康CelCode®高通量单细胞测序系统检测人PBMC样本,将同一份人PBMC样本分为两份,进行两次独立单细胞测序测试,结果显示两次测试数据细胞聚类分群一致,基因中位数分别为1,847和1,891,说明该系统稳定强,可重复性好。

 

 

人PBMC样本两次独立测试结果展示

 

 

实测不同组织基因检出数量数据统计

 

 

 

 

配套仪器与软件

 

CelCode® Driver高通量单细胞平台

 

CelCode® 高通量单细胞转录组芯片BA1

 

CelSence® 生信分析软件

 

BestopCell生信分析云平台